之后在卡卡西第一次发现兜的时候说过这样一句话，“竟然没费什么劲就把我派来的暗部忍者给消灭了”，这时暗部的设定又再次更改，不单单是火影了，就连卡卡西这样的普通上忍也能够调派暗部忍者了，或许这是为了体现出此时兜的实力，但是岸本已经擅自更改了设定。
直到大蛇丸和砂忍村的忍者联合进攻木叶时期，暗部再次登场，这时的暗部再次登场充当了三代火影猿飞日斩的保镖，已经不单单是执行暗杀的忍者了，保护木叶和保护火影都成为了任务，三代火影陷入苦战，而这些暗部人员却在旁边直呼666，说好的保护呢？显然做不到。
其实从三代火影之后的暗部就已经变味了，他们不再是暗杀部队，而是代替了另一个职业，也就是当初宇智波一族担任的木叶警备部队，几乎所有关于木叶的战斗暗部都能出现，他们的主要任务就是负责木叶的安保工作。
直到他的出现，也就是团藏，团藏的出现才彻底的稳住了这个站在阴暗中的部队，团藏所带领的暗部才是真正意义上和最初设定相符合的暗杀部队，而不是站在表面名叫暗杀实际上是“维稳”的部队。
虽然团藏是后期才出现的人，但是实际上他的出现才让忍者这个形象更立体，忍者本身就是实行暗杀的职业，而在火影这个正能量的设定中自然不会表现太多，而团藏的出现恰恰弥补了这一点，暗部就是暗部，本来就是沾满鲜血的刽子手，而团藏的出现就是身为忍者最后的底线，暗部就是暗部，从来不是什么光明的工作。
那么针对暗部的前后矛盾你有什么看法呢？欢迎在评论区留言讨论哦。返回搜狐，查看更多